arXiv cs.LG· Ziyuan Gao·· 19 天前AI 评分34
扰动预测模型是否学到了基因相互作用?智能体筛选中的外推诊断研究
Do Perturbation Predictors Learn Gene Interactions? Diagnosing Extrapolation in Agentic Screening
AI 导读
针对未测基因组合效应的预测难题,研究人员提出通过对比模型预测与单基因效应相加的基线,构建度量额外相互作用的加性差异指标(AD)。在 8 种预测方法和 3 个 Perturb-seq 数据集上的评测显示,专用神经预测模型并未始终超越简单的加性基线,且偏离加性基线越大的预测往往误差越大。该指标相比传统置信度信号表现更稳定,可用于指导智能体扰动筛选流程的决策。
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