arXiv cs.AI· Zhenqiao Song, Jianwen Xie, Lei Li·· 19 天前AI 评分33
面向蛋白质界面设计的离散与 SE(3) 联合扩散框架 PIDiff
Joint Discrete and SE(3) Diffusion for Protein Interface Design
AI 导读
研究团队提出多模态扩散框架 PIDiff，通过耦合离散序列与连续 SE(3) 结构流形的扩散，联合生成靶标条件的蛋白质序列与结构。该框架采用融合几何感知不变点注意力与全局序列自注意力的 PIFormer 架构，并在 PIBench 数据集上预训练。在微型结合蛋白和抗体设计任务中，其序列设计成功率、结构结合能及协同可设计性指标均优于基线方法。
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